Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA5O15230 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms