Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms