Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGB1P1B2RPK0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms