Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms