Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD8B2A6NJW9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms