Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPB13A6NJU9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms