Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GOLGA6L9A6NEM1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms