Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC78A2IDD5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms