Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms