Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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UBE2J1Q9Y385 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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UBE2J1Q9Y385 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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