Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNIP3Q9Y2W7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms