Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM35Q9UPQ4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
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