Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMCC3Q9ULS5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms