Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms