Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MLH3Q9UHC1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms