Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPASTQ9UBP0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms