Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
XCL2Q9UBD3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms