Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms