Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP36Q9P275 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP36Q9P275 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms