Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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