Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNK4Q9NYG8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms