Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDP1Q9NUW8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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