Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB6BQ9NRW1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms