Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NRIP3Q9NQ35 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms