Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMG20AQ9NP66 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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