Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMBRA1Q9C0C7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms