Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM8Q9BZR9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms