Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCP2Q9BX26 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms