Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMEM208Q9BTX3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms