Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CRACR2AQ9BSW2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms