Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX2Q9BQ50 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms