Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP9Q99956 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms