Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NPAS2Q99743 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS2Q99743 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms