Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCNAQ96QF7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms