Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HLA-CQ95604 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-CQ95604 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms