Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HGDQ93099 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HGDQ93099 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HGDQ93099 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HGDQ93099 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HGDQ93099 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HGDQ93099 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HGDQ93099 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HGDQ93099 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HGDQ93099 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms