Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOPBP1Q92547 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms