Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
APOBEC4Q8WW27 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms