Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HJURPQ8NCD3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms