Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC4Q8N9L1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms