Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP4Q8N3C7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms