Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC28Q86X40 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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