Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNMB4Q86W47 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms