Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms