Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTE2Q6XPS3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms