Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SAMD13Q5VXD3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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SAMD13Q5VXD3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SAMD13Q5VXD3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SAMD13Q5VXD3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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