Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AMER1Q5JTC6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER1Q5JTC6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms