Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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