Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT24Q2M2I5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms