Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC27Q2M243 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms